Bien, en ayant chercher un peu j'ai un début de réponse.
Un post de de Karine38 dans le post des Permis stage 2013 indique une situation similaire, elle a fait un stage dans une université par le biais de cette procédure.
En revanche, je ne sais toujours pas quelle est la différence entre les deux procédures, et laquelle serait la plus appropriée.
Merci à tous.
Le problème que je vois c'est que les demandes de visa de stage soop sont sujet à quotas.
Je ne connais pas de retour de personnes ayant demandé directement un permis de travail à la frontière pour un stage dans un labo d'université. A priori ça semble possible